Руководителем организации явлется главный врач учреждения. ФГБУЗ ЦГиЭ № 15 ФМБА России имеет в своём составе испытательный лабораторный центр (ИЛЦ) и орган инспекции (ОИ). Руководителем испытательного лабораторного центра является главный врач учреждения (Вылегжанина Е.А.), руководителем органа инспекции - заведующая отделом обеспечения госсанэпиднадзора (Семёнова Е.А.)
В составе ФГБУЗ ЦГиЭ № 15 ФМБА России есть ряд лабораторий и отделов. На нашей базе действует единственная в городе бактериологическая лаборатория, которая проводит широкий спектр клинико-диагностических и санитарно-бактериологических исследований. Также в Центре имеется отдел обеспечения госсанэпиднадзора, занимающийся контролем условий труда на объекте ФГУП «РФЯЦ-ВНИИТФ им.академ. Е.И. Забабахина» и городских предприятиях. Специалисты санитарно-гигиенического отделения совместно со специалистами Межрегионального управления № 15 ФМБА России контролирует выполнение санитарных требований в школах, детских садах, больницах, парикмахерских, заведениях общепита. Экспертные проверки необходимы при лицензировании фармацевтического, медицинского, образовательного видов деятельности и при работе с источниками ионизирующего излучения. Еще один отделение — эпидемиологическое — занимается расследованием очагов инфекционных заболевай и организацией проведения в них противоэпидемических мероприятий, обследованиями населения города при эпидемиологической заболеваемости и обработкой инфекционных очагов. Работу всех отделов обеспечивают две лаборатории: бактериологическая лаборатория с паразитологическим отделением и санитарно-гигиеническая лаборатория.